Su nombre fue tomado de la sobrina del cacique Calarcá, perteneciente a la tribu de los Pijaos de la cultura indígena Quimbaya, quienes inicialmente habitaron este municipio. El barrio “Ciudad Boquía” inicia con  597 soluciones de vivienda y fue inaugurado el 28 de junio de 1991, por el entonces ministro de desarrollo doctor Ernesto Samper Pizano y bajo el gobierno del  presidente doctor Cesar Gaviria Trujillo

A partir de esta fecha comienza la adjudicación de viviendas, calculando una población escolar promedio de 800 menores para educación básica primaria, razón por la cual surge la necesidad de tener dentro del barrio una institución educativa para evitar los peligros que ocasionan el desplazamiento hacia otras instituciones educativas y la erogación de los gastos que ello incluye. Ante esta gran dificultad surgió al interior de la primera junta de acción comunal y demás habitantes del sector, la idea de realizar un proyecto de construcción y dotación de una institución educativa, acorde con las necesidades de la época.

La institución educativa ciudad boquia fue construida hace muchos años que conmemoraron a la princesa boquia, la cual murió y fue sepultada en la institución.  

A el paso de los años han echo mejoras significativas las cuales las podemos ver en la estructura y los docentes.

Por la institución han pasado varios coordinadores y rectores los cuales han dejado un gran aporte a el pasar de los años.